在BAF整个工艺过程中，锰砂滤料对BAF工艺的运行以及工艺对污水的处理效能具有重要的影响。这是因为滤料在BAF工艺中作为微生物的载体，承担着微生物的附着以及固定的媒介作用，直接影响着BAF内微生物的生长、繁殖和脱落的整个过程，从而影响了BAF工艺对污水的去污效能。滤料在BAF工艺中具有多重作用：
1、滤料本身可作为一种吸附剂吸附并截留污废水中的悬浮物；
2、滤料可以作为微生物的附着、固定的场所；
3、滤料可在BAF工艺中起到切割、阻挡气泡的作为，增大氧气、废水、微生物三者之间的接触表面积。
因此滤料的选择不仅在一定程度上影响着BAF反应器中的水动力状态，而且还决定了可供微生物附着生长的比表面积的大小，从而很大程度上影响着BAF反应器能否高效运行及净水效能的优劣。
不同型号的BAF工艺对所配置的滤料有一定的差异。如BIPOSTYR和BIOPUR工艺因其运行过程中水流方向不同而适合以聚乙烯塑料为滤料；BIOBEAD工艺因其运行过程中水流为升流式而适合采用聚乙烯塑料为滤料；SAFE和BIOCAR-BONE工艺因其运行原料与其他BAF工艺不同而适合用膨胀页岩类为了滤料；B2A工艺因其对处理各种污水具有很强的适用性因而可选用多种滤料。故滤料作为BAF工艺过程不可分割的一部分，BAF工艺的发展与滤料的快速发展息息相关。
